Öncesi: Okulumuzun kurulduğu bina, 1950 yılında İmam Hatip Koruma Derneği tarafından yaptırılmış ve 1951’de Türkiye’de ilk açılan yedi İmam Hatip Lisesinden biri olan Kahramanmaraş İmam Hatip Lisesine tahsis edilmiştir(1954-1950). Eğitim öğretim amaçlı kullanılan bu binaya(A Blok olarak adlandırılmış) 1962 yılında pansiyon binası ilave edilmiştir(B Blok). A(eğitim) ve B Bloklar(pansiyon) İmam Hatip Lisesi tarafından 1978-1979 eğitim öğretim yılına kadar kullanılmıştır. İmam Hatip Lisesi 1980’de Karamanlı Mahallesindeki yeni binasına taşınınca boş kalan bu iki blokta şehrimizin ilk Anadolu Lisesi açılmıştır. Çukurova Elektrik A.Ş. tarafından Anadolu Lisesine yeni bina yaptırılınca bu okul Çukurova Elektrik Anadolu Lisesi adını alarak bugünkü kendi binasına taşınmıştır(1989).
Okulumuz açılıyor: Boşalan bu binalarda(A ve B Bloklar) Kahramanmaraş Valiliğinin teklifi ve Bakanlığımızın onayı ile 1989-1990 ders yılında okulumuz eğitim öğretime başlamıştır.Şehrimizde “kız lisesi” ve Atatürk’ün adını taşıyan başka bir lise bulunmaması nedeniyle okulumuzun adının “Atatürk Kız Lisesi” olması uygun görülmüştür. Aynı yıl her iki blok da öğretim binasına dönüştürülmüştür. Okulumuz açıldığında büyük yoğunlukla Lise-1. sınıfa öğrenci kaydı yapılmakla birlikte ara sınıflardan gelen nakillerle üst sınıflara da öğrenci alınmıştır. Nakil gelen öğrenciler dolayısıyla (2 öğretim yılı sonunda) 1990 – 1991 ders yılı sonunda ilk mezunlarını vermiştir.
Atatürk Kız Lisesinin eğitim gördüğü aynı binalarda(A – B Blok) 1990-1991 ders yılı başında Anadolu Öğretmen Lisesi de açılmış; 1998-1999 ders yılı başında Anadolu Öğretmen Lisesi yeni binasına taşınıncaya kadar aynı binada iki okul 8 yıl birlikte eğitim öğretime devam etmiştir. Okulumuzun İmam Hatip Lisesi, Çukurova Elektrik Anadolu Lisesi ve Öğretmen Lisesi gibi şehrimizin eğitim tarihinde ve eğitim hayatında köklü, seçkin ve nitelikli okullarla birlikte olması, hem bu okulların hem de Merkez Atatürk Anadolu Lisesinin kurumsal tarihi açısından kayda değer ortak nokta olarak görünmektedir.
1996-1997 ders yılında okulumuz bünyesinde “Yabancı Dil Ağırlıklı Lise (Süper Lise)” de açılarak klasik lisemizle birlikte eğitime başlamıştır.
On iki yıl kız lisesi olarak eğitim veren okulumuzun 2000-2001 ders yılı başında Bakanlığımızın onayı ile “kız lisesi” özelliği kaldırılmış ve okulumuz karma eğitime geçerek “Atatürk Lisesi” adıyla devam etmiştir.
Bakanlığımız Orta Öğretim Genel Müdürlüğünün 05.07.2005 tarih ve 7374 sayılı Oluru ile okulumuz, Kahramanmaraş Merkez Atatürk Anadolu Lisesi’ne dönüştürülmüş ve sınavla öğrenci alan okullara dâhil edilmiştir. Bu tarihten sonra Atatürk Lisesine yeni öğrenci kaydı yapılmayarak, mevcut öğrencileri mezun edinceye kadar eğitime açık tutulmuştur. Okulumuz 13.04.2015 tarihinde “Yirmiikigün Mah. 91003. Sokak NO:1 Onikişubat” adresli yeni yerine taşınmıştır. Taşınma işlemlerinden sonra okulumuza akıllı tahta dağıtımı yapılmıştır.
2018-2019 eğitim öğretim yılında okulumuzun sınavla öğrenci alma hükmü kaldırılarak yerel yerleştirme ile 9. Sınıfa öğrenciler almaya başlamıştır. Bununla birlikte okulumuz yerel yerleştirme puanıyla öğrenci alan en yüksek okullardandır. 6 Şubat 2024 Kahramanmaraş Depreminde okul binamız zarar görmemiş ve hasar kaydı almayarak sonrasında normal eğitim öğretime devam eden okullardan biridir.